청소년센터는 ▲청소년참여위원회(부천시 청소년 정책 제안 등) ▲청소년운영위원회(청소년센터 운영 전반에 대한 자문·평가 등) ▲청소년자원봉사기획단(지역 봉사활동 기획 및 실천) ▲청소년마을기획단(마을활동 및 기획활동) ▲청소년환경탐사대(원미산 자연 및 생태활동) 등 자치기구를 구성해 운영한다.

자치기구 활동에 참여하는 청소년들에게는 위촉장이 수여되고, 프로그램 기획 및 운영, 활동에 따른 자원봉사확인서 발급과 각종 교육 및 활동 참여 기회가 제공된다. 또한 우수활동 청소년에게는 연말 표창장 수여 등의 기회도 주어진다.

자치기구별 모집기간과 대상이 다르므로 각각의 모집기준을 확인해야 하며, 자세한 사항은 전화로 문의하거나 센터별 홈페이지 공지사항에서 확인할 수 있다.

한편, 청소년센터는 청소년이 끼와 열정을 마음껏 펼치고 꿈을 실현하는 공간으로, 문화예술·생태환경·미디어 등 다양한 활동과 청소년의 자기 주도적 참여 활동을 통해 지역사회 발전과 민주시민으로서의 성장을 지원한다.